Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CUL1Q13616 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CUL1Q13616 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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