Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms