Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms