Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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