Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANK3Q12955 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms