Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC173Q0VFZ6 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CCDC173Q0VFZ6 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CCDC173Q0VFZ6 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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CCDC173Q0VFZ6 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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CCDC173Q0VFZ6 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CCDC173Q0VFZ6 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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