Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms