Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PRKCHP24723 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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