Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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