Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms