Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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