Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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