Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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