Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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