Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SS18Q15532 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SS18Q15532 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms