Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGA9Q13797 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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