Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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