Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
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