Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL589666.2-201ENST00000624603 618 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF92-202ENST00000357512 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF200-203ENST00000396871 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PIWIL3-202ENST00000527701 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF169-203ENST00000480716 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL160290.1-201ENST00000415509 416 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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CLN3Q13286 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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CLN3Q13286 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FTH1P4-201ENST00000480365 553 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC117498.2-202ENST00000549864 473 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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