Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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