Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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