Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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