Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms