Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
RPS29P62273 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.89
RPS29P62273 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPS29P62273 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms