Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
TMPOP42166 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms