Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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HOXA13P31271 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXA13P31271 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXA13P31271 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXA13P31271 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXA13P31271 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXA13P31271 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXA13P31271 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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