Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ECHS1P30084 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms