Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms