Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM71Q2Q1W2 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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