Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms