Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USF2Q15853 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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