Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms