Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms