Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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