Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCIRG1Q13488 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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