Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TSPAN18-201ENST00000340160 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ADGRE3-202ENST00000344373 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 GNE-206ENST00000543356 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC011815.1-201ENST00000586922 4382 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC02363-201ENST00000317596 2153 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SERPINA9-202ENST00000337425 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 USP2-AS1-201ENST00000498979 2486 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SLMAP-220ENST00000495364 1383 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MAPK10-386ENST00000642038 2354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CKAP2-201ENST00000258607 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AP3M1-202ENST00000372745 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 FAM149B1P1-201ENST00000533428 1610 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 USP4-202ENST00000351842 3222 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PABPC1L-203ENST00000217075 670 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 COQ3-202ENST00000369240 646 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL133406.1-201ENST00000404904 747 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC01834-201ENST00000567374 385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MIR3972-201ENST00000582732 87 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC008734.2-201ENST00000595277 477 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SNX18P5-201ENST00000619873 868 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 OR1B1-201ENST00000623530 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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MKRN4PQ13434 ANKRD55-201ENST00000341048 2502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CDC25C-201ENST00000323760 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ZNF207-204ENST00000394673 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 DDX24-210ENST00000622786 1730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC084876.2-201ENST00000624844 1709 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TXLNB-201ENST00000358430 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 GSN-AS1-201ENST00000414544 4763 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EFHC1-213ENST00000635996 2548 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ITGA10-204ENST00000539363 4735 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC139495.3-201ENST00000515156 4437 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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MKRN4PQ13434 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 KANSL2-201ENST00000420613 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ESRRG-207ENST00000366940 5314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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MKRN4PQ13434 OPCML-208ENST00000612177 6250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CYCSP5-201ENST00000415043 297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL513318.1-201ENST00000437925 991 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC012307.1-201ENST00000449242 197 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AP000266.1-201ENST00000450936 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TUBB3P2-201ENST00000480063 232 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC00544-202ENST00000481738 575 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL096701.3-202ENST00000483736 615 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC136628.1-201ENST00000503218 561 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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