Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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ITGB3BPQ13352 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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ITGB3BPQ13352 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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ITGB3BPQ13352 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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ITGB3BPQ13352 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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ITGB3BPQ13352 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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