Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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