Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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