Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
C4orf47A7E2U8 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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