Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SCN11AQ9UI33 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SCN11AQ9UI33 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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