Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OR4E2-201ENST00000408935 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP000317.1-201ENST00000427022 805 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01865-202ENST00000436808 853 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC004801.2-201ENST00000468202 779 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BX890604.1-206ENST00000471090 922 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SSR2-215ENST00000529008 849 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ULK4P3-201ENST00000563895 440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC022165.1-201ENST00000568771 596 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC074029.3-201ENST00000618623 312 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.20-201ENST00000619896 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IL15-207ENST00000514653 1388 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OCM-201ENST00000242104 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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