Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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