Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms