Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms