Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 COL12A1-201ENST00000322507 11723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SVOP-205ENST00000610966 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SIPA1L2-201ENST00000262861 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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