Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC209005.1-201ENST00000514043 464 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 MIR4266-201ENST00000583300 55 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC091885.2-201ENST00000510391 1791 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTF1Q16619 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms