Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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