Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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