Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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CUL1Q13616 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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